Технологию CRISPR часто обвиняют в непредсказуемости и высоком риске нецелевых мутаций. Британские исследователи разработали подход, который сделает генное редактирование более безопасным. Алгоритм под названием FORECasT позволяет точно определить, как клетка отреагирует на вмешательство в ее ДНК.
Технология CRISPR/Cas9 — эффективный инструмент, позволяющий ученым исследовать функции и эволюцию отдельных генов. Кроме того, генное редактирование все чаще используется на практике, например, в сельском хозяйстве и медицине. Однако скептики уверены, что технология связана со слишком высоким риском нецелевых мутаций.
Команда исследователей из британского Института Сенгера разработала методику, которая позволит предсказывать мутации, возникающие в результате применения CRISPR. Для этого ученые неоднократно отредактировали 40 000 нуклеотидных оснований, а затем секвенировали и проанализировали миллионы полученных фрагментов. Ка сообщает Science Daily, это исследование — самая масштабная оценка воздействия CRISPR на геном.
Исследование показало, что реакция на генное редактирование зависит от того, в какой именно точке оно производится.
«Скормив» экспериментальные данные алгоритму, ученые получили вычислительный инструмент, предсказывающий, как именно будет выглядеть та или иная последовательность ДНК после вмешательства с помощью CRISPR.
Алгоритм, получивший название FORECasT, позволит сэкономить время и ресурсы при использовании генного редактирования. Его применение сделает работу ученых более точной, а саму технологию CRISPR более предсказуемой и безопасной.
Journal information