luckyea77 (luckyea77) wrote,
luckyea77
luckyea77

Category:

Революционная программа сократит время и стоимость секвенирования ДНК



ПО можно использовать на портативных устройствах для ускорения генетических тестов и диагностики вне лабораторий. Новая технология позволяет собирать и секвенировать специфические гены без подготовки образцов и прочих предварительных этапов, которые требуют стандартные методы.

Команда исследователей из Университета Джонса Хопкинса разработала новое программное обеспечение, способное произвести революцию в секвенировании генома, от ДНК дрожжей до рака, сообщает Phys.org. «Я думаю, мы навсегда изменим технологию секвенирования», — заявил профессор Майкл Шатц, старший автор статьи.

Новый процесс сокращает время определения мутаций генов с 15 дней и более до трех. Это позволяет ученым понять и диагностировать состояние здоровья практически немедленно и не тратить средства и время на предварительную подготовку и дополнительные анализы.

Для того чтобы стало понятно, насколько новая программа ускоряет процесс секвенирования, профессор Шатц приводит сравнение с поиском фильма на Netflix. Стандартные методы требуют просмотреть каждую секунду каждого фильма, чтобы найти то, что нужно. Адаптивное секвенирование быстро распознает неподходящее кино и сразу переходит к следующему.

На разработку, написание и тестирование алгоритма, получившего название UNCALLED у ученых ушло два года. Он идентифицирует молекулы ДНК, когда те проходят через крошечные электрические отверстия, или «нанопоры», внутри так называемых нанопоровых секвенаторов. Программа считывает данные и сверяет их с базой данных за доли секунд. Нужные молекулы получают возможность пройти сквозь пору, а если через отверстие пытается проникнуть не та молекула, программа, меняя напряжение в нанопоре, физически выталкивает ее, как привратник на входе в ночной клуб.

UNCALLED может работать на стандартном оборудовании для секвенирования, не требуя специальных реагентов или катализаторов. Выбор генов или геномов для секвенирования контролируется полностью программой и в любой момент может быть изменен.

Tags: ДНК, гены, медицина
Subscribe

Posts from This Journal “ДНК” Tag

promo luckyea77 december 30, 15:00 8
Buy for 10 tokens
По этой ссылке можно скачать информационную базу для программы "1С:Предприятие". С помощью данной базы можно готовиться и сдавать экзамены по темам: - Электробезопасность - Основы промышленной безопасности А.1 - Специальные требования промышленной безопасности: Б 9.31. Эксплуатация опасных…
  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 4 comments